Hanseong Roh
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**고광일 교수님 데이터중에서 Gene ID가 Human Go annotation과 일치하는 것이 있으면 그것도 진행하도록 하자 | **고광일 교수님 데이터중에서 Gene ID가 Human Go annotation과 일치하는 것이 있으면 그것도 진행하도록 하자 | ||
***Conversion of Uniprot id to Unigene id & GO assignment [http://compbio.korea.ac.kr/~igchoi/p2g2go.tar.gz p2g2go.tar.gz] | ***Conversion of Uniprot id to Unigene id & GO assignment [http://compbio.korea.ac.kr/~igchoi/p2g2go.tar.gz p2g2go.tar.gz] | ||
+ | **Minimum Spanning Tree - 전체 네트워크 그래프에서 minimum spanning tree를 구해볼것 | ||
+ | **Clique - 전체 네트워크 그래프에서 Cliques들을 구해볼것 | ||
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*Cytoscape[http://www.cytoscape.org/ homepage] | *Cytoscape[http://www.cytoscape.org/ homepage] |
Revision as of 10:32, 27 March 2008
Contents |
Introduction
Research Interests
- SNP란?[1]
- iGEM catalog[2]
Resource for Hansung
- OMIM download
- Human disease network raw data (물리학과 고광일 교수제공)
- Dive into Python (Book)
- NetworkX Python network analysis tool
- Python: multiple key values in 'dict' type cookbook
- python 대소문자 전환 module : string
- 한글이 깨져 보일 때: View(보기)->Encoding(인코딩)->Korea(한국어)
- Gene Ontology Data
- Human GO annotation Human GO Download
- GO mapping GOA slim mapping
- GO Slim GO Slim categories
- Gene association DB data (NIH) Download
- 먼저 molecular function만 고려해 보거라
- 고광일 교수님 데이터중에서 Gene ID가 Human Go annotation과 일치하는 것이 있으면 그것도 진행하도록 하자
- Conversion of Uniprot id to Unigene id & GO assignment p2g2go.tar.gz
- Minimum Spanning Tree - 전체 네트워크 그래프에서 minimum spanning tree를 구해볼것
- Clique - 전체 네트워크 그래프에서 Cliques들을 구해볼것
- EST analysis
- Hitchhiker's guide for EST anlysis (PDF)
- wiki manual
Reporte Progress
For Fun
Win XP Games's easter egg