In-Geol Choi
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+ | drv=dbDriver("MySQL") | ||
+ | con = dbConnect(drv,username="",password="",dbname="umls") | ||
+ | rs = dbSendQuery(con,statement=paste("select CUI,GROUP_CONCAT(SDUI separator \',\') from MRCONSO","WHERE SAB="OMIM")) | ||
+ | data = fetch(rs,n=-1) | ||
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*한성: 네 Data의 summary이다. | *한성: 네 Data의 summary이다. |
Revision as of 17:35, 29 July 2008
Contents |
Introduction
인간질병네트워크
UMLS
- MRHIER,MRCONSO,MRXNW_ENG,MRRELM
- install.packages("DBI")
install.packages("RMySQL") library("RMySQL") library(DBI) library("RMySQL")
drv=dbDriver("MySQL") con = dbConnect(drv,username="",password="",dbname="umls") rs = dbSendQuery(con,statement=paste("select CUI,GROUP_CONCAT(SDUI separator \',\') from MRCONSO","WHERE SAB="OMIM")) data = fetch(rs,n=-1) data
GAD
- 한성: 네 Data의 summary이다.
- 총 6723 record중에 중복된것을 제거하면 6696인데 이전 데이터보다 늘어난것 같다 (이전데이터는 8088->6144). 왜인지?
- 19 Dis. Class, 2859 Dis. types, 1316 Dis. genes
- Hs.##### 의 Description 정보를 다오. 일례로 두번째로 많은 링크를 가지고 있는 Hs.370955는 사용되지 않는 식별자이다
Misc.
Paul W. K. Rothemund manipulated molecules of DNA to create smiley faces that are one one-thousandth the width of a human hair. | |
Huge dust storms can be easily seen from space like this dust from China blowing across Korea and Japan in April 2002. |