Panpyro

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Latest revision as of 04:22, 17 June 2010

2010.6.15
- 환경설정 변경: MPICH 경로를 로컬(/home/users/roh329/tools/OPENMPI_1.4)로 변경, 처음 설정은 메모리 문제로 libmpi.so 를 사용하지 않도록 되어 있었음. 원본(/home/users/roh329/log/environment)
2010.6.13
- abyss 1.2.0 (openmpi사용,google sparsehash사용)
- google sparsehash /home/users/roh329/tools/google-sparsehash
- openmpi 1.4.2 로컬에 설치 /home/users/roh329/tools/OPENMPI_1.4
2009.10.16
- RNAMMER
2009.10.?
- HMMER
2009.10.12
- Perl module - Moose
2009.09.29
- tRNAscan-SE (bin 폴더 path에 넣기 필요)
2009.09.27
- Glimmer3.02 /home/users/roh329/tools/glimmer3.02/bin
- signalp /home/users/roh329/tools/signalp-3.0/bin graphic이용할려면 ghostview 설치 필요
- /var/www/cgi-bin/prok_manatee/conf/Manatee.conf 수정

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-==[[Linux cluster]]==
 ==OS==
 *Centos (HPC Korea]
+*[[Linux cluster]]: Tips & configuration
 ==Installed Softwares==
 *NFS
 ==History==
+*2010.6.15
+**환경설정 변경: MPICH 경로를 로컬(/home/users/roh329/tools/OPENMPI_1.4)로 변경, 처음 설정은 메모리 문제로 libmpi.so 를 사용하지 않도록 되어 있었음. 원본(/home/users/roh329/log/environment)
+*2010.6.13
+**abyss 1.2.0 (openmpi사용,google sparsehash사용)
+**google sparsehash /home/users/roh329/tools/google-sparsehash
+**openmpi 1.4.2 로컬에 설치 /home/users/roh329/tools/OPENMPI_1.4
+*2009.10.16
+**RNAMMER
+*2009.10.?
+**HMMER
+*2009.10.12
+**Perl module - Moose
+*2009.09.29
+**tRNAscan-SE  (bin 폴더 path에 넣기 필요)
 *2009.09.27
 **Glimmer3.02  /home/users/roh329/tools/glimmer3.02/bin
 **signalp /home/users/roh329/tools/signalp-3.0/bin    graphic이용할려면 ghostview 설치 필요
 **/var/www/cgi-bin/prok_manatee/conf/Manatee.conf 수정
-*2009.09.29
-**tRNAscan-SE  (bin 폴더 path에 넣기 필요)
-*2009.10.12
-**Perl module - Moose
-*2009.10.?
-**HMMER
-*2009.10.16
-**RNAMMER
-*2010.6.13
-**abyss 1.2.0
-**google sparsehash /home/users/roh329/tools/google-sparsehash