Panpyro

From CSBLwiki

OS

• Centos (HPC Korea]
• Linux cluster: Tips & configuration

Installed Softwares

• NFS

History

• 2010.6.15
  • 환경설정 변경: MPICH 경로를 로컬(/home/users/roh329/tools/OPENMPI_1.4)로 변경, 처음 설정은 메모리 문제로 libmpi.so 를 사용하지 않도록 되어 있었음. 원본(/home/users/roh329/log/environment)
• 2010.6.13
  • abyss 1.2.0 (openmpi사용,google sparsehash사용)
  • google sparsehash /home/users/roh329/tools/google-sparsehash
  • openmpi 1.4.2 로컬에 설치 /home/users/roh329/tools/OPENMPI_1.4
• 2009.10.16
  • RNAMMER
• 2009.10.?
  • HMMER
• 2009.10.12
  • Perl module - Moose
• 2009.09.29
  • tRNAscan-SE (bin 폴더 path에 넣기 필요)
• 2009.09.27
  • Glimmer3.02 /home/users/roh329/tools/glimmer3.02/bin
  • signalp /home/users/roh329/tools/signalp-3.0/bin graphic이용할려면 ghostview 설치 필요
  • /var/www/cgi-bin/prok_manatee/conf/Manatee.conf 수정