Progress jihee

From CSBLwiki

Contents 1 Project 2 Progress 3 Reference

Project

• Mycopedia
• Mycoremed

• 목표:진균계를 웹상에서 깔끔하게 분류 하고 데이터를 입력하여 유용하게 쓰이도록 한다.

• step1: NCBI에서 받은 데이터를 파이썬 으로 Fungi만 뽑아내 fungi의 계통 데이터를 만들어 활용할수있도록 하자?! 입니다.
  • 뭐가 필요한가?:파일이 두개이고 한파일안의 두데이터를 key와 value로 나눠 서 원하는 데이터를 활용 하기 위하여 파일을 불러와서 활용하는것과 데이터를 이용하는것에 기초와 능숙하게 쓸수있도록 하는것이 필요함
• step2
  • 위에서 뽑아낸 데이터를 위키에서 페이지를 만들수 있도록 [링크,이름]으로만들어주는 스크립트를 짜서 활용.
  • 위키문법과 위키를 제대로 활용하기 위한 방법에 대한것
• step3 NCBI에서 18s rRNA 데이터만 추출 하고, 그것을 쉽게 데이터 활용할수있도록 함
• step4 웹상에서 깔끔하게 편리하게 보일수있도록 할수있어야함

Progress

Mediawiki Import

대량의 텍스트를 위키문서로 전환?

• 여러가지 화일형식으로부터 위키문서로 전환하는 방법들 - 여기에다 자동으로 위키에다 업로드까지 하면 데이터입력이 아주 쉽겠다

1.ncbi taxonomy data에서 fungi 의 데이터만 뽑아냈음

2.

Reference

• wiki formatting - 위키문서작성시 참고