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	;Readings		;Readings
-	:[http://www.nature.com/nbt/journal/v28/n3/abs/nbt.1614.html Compbio primer @NBT]	+	:[http://www.nature.com/nbt/journal/v28/n3/abs/nbt.1614.html] Compbio primer @NBT
-	:[http://www.inf.ed.ac.uk/teaching/courses/csb/CSB_lecture_flux_balance_analysis.pdf A Lecture Note]	+	:[http://www.inf.ed.ac.uk/teaching/courses/csb/CSB_lecture_flux_balance_analysis.pdf] A Lecture Note about FBA
-	:[http://bib.oxfordjournals.org/content/10/4/435 Flux balance analysis of biological systems: applications and challenges]	+	:[http://bib.oxfordjournals.org/content/10/4/435] Flux balance analysis of biological systems: applications and challenges
-	:[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16772264 Flux balance analysis in the era of metabolomics]	+	:[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16772264] Flux balance analysis in the era of metabolomics
	:[http://www.pnas.org/content/99/23/15112.abstract] MOMA		:[http://www.pnas.org/content/99/23/15112.abstract] MOMA

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Revision as of 03:56, 16 May 2011

Contents 1 Research 1.1 Flux Balance Analysis 2 Log 2.1 3월 26,27일 토,일 2.2 4월 2,3일 토,일 2.3 4월 15,16,17일 금,토,일 2.4 4월 30일, 5월 1일 토,일

Research

Flux Balance Analysis

Flux Balance Analysis - wikipedia

Readings

[1] Compbio primer @NBT

[2] A Lecture Note about FBA

[3] Flux balance analysis of biological systems: applications and challenges

[4] Flux balance analysis in the era of metabolomics

[5] MOMA

R-package (practices)

limSolve

limSolve example

Log

3월 26,27일 토,일

1. 올려주신 lecture노트 공부
2. 올려주신 Flux balance analysis of biological systems: applications and challenges 앞부분 공부

4월 2,3일 토,일

1. R설치, Bioconductor 설치(?)
2. 선형 대수학 1~3강 수강(itunes에서 다운로드후 수강)

4월 15,16,17일 금,토,일

1. 선형대수학 5강

4월 30일, 5월 1일 토,일

1. systems Biology 9장 보았습니다. 내용이 너무 깊게 들어가서 읽는 도중 방향을 바꾸었습니다. 어느정도 지식이 쌓이면 꼭 한번 읽어보아야 겠습니다!
2. E_coli example을 이리저리 다시한번 보았습니다.
3. linear programming 공부 - 이것의 내용 자체는 고등학교 수2 수준인 것 같습니다. 복잡해졌을 때 푸는 법을 좀더 보아야 합니다.
4. FBA 관련 글 13개 발견 - 저번에 보여주신 사이트에 있던 것인데, lecture note에 optimization에 관한 내용 있습니다. 주중에 틈틈이 읽어볼 예정입니다.
5. R 패키지의 E_coli 예제 중 lsei 를 보았습니다. 자세히는 보지 못하였는데, 실마리를 푸는데 도움이 될 것 같습니다.