Raw data

• NCBI FTP 를 이용하여 총 33 종의 genome sequence 를 얻었으나, 이 중 mitochondrial genome 등 whole genome sequence가 아니거나 KO로 annotation이 되지 않는 genome 을 제외 하고 16종의 fungi 만을 분석하였다.

• 알고리즘에 사용된 fungi는 다음과 같다.

• KOs 는 KEGG orthologs 를 뜻하며 각 genome의 40~50% 정도의 gene이 KO 로 annotation 된다. 현재 NCBI 에는 정확하게 알려진 whole genome sequence 보다 supercontig 등 순서가 정확하게 알려지지 않은 sequence 부분으로 이루어진 데이터가 많으며, gene의 수가 눈에 띄게 적은 genome sequence의 경우는 많은 genome이 아직 알려지지 않은 케이스 이다.

Result

• MUM database